O processo decisório na Universidade Feevale prima pelo modelo democrático, buscando o envolvimento de todas as partes interessadas. Em 2018, compõem a estrutura organizacional da Instituição:

Órgão mantenedor:

• Associação Pró-Ensino Superior em Novo Hamburgo (Aspeur)

Órgão colegiado de deliberação superior:

• Conselho Universitário (Consu)

Órgãos de administração:

• Administração geral, exercida pelo Reitor

Pró-reitorias:

• Pró-reitoria de Ensino (Proen)
• Pró-reitoria de Pesquisa, Pós-graduação e Extensão (Proppex)

Diretorias:

• Diretoria de Novos Negócios
• Diretoria de Inovação
• Diretoria de Relações Internacionais e Institucionais
• Gestão Executiva

Órgãos intermediários de administração:

• Institutos acadêmicos
• Cursos e/ou programas
• Escola de Educação Básica Feevale – Escola de Aplicação
• Feevale Techpark

Órgãos suplementares:

• Comissão Própria de Avaliação (CPA)
• Conselho de Ensino (Conen)
• Conselho de Pesquisa e Pós-graduação Stricto Sensu (CONPPG)
• Conselho de Extensão (Conex)
• Comitê de Ética em Pesquisa (CEP)
• Comissão de Ética no Uso de Animais (CEUA)
• Comissão de Residência Multiprofissional em Saúde (Coremu)
• Comissão de Residência Médica (Coreme)
• Comissão Local de Acompanhamento e Controle Social do Programa Universidade para Todos – Prouni (Colap)